上海房地产经纪机构备案证明的查询和办理流程如下：

备案证明的查询：

1. 可以通过上海市住房和城乡建设管理委员会网进行查询。
2. 进入官网后，在“便民查询”栏里找到“企业备案信息查询”，输入房地产经纪机构名称，按“查询”。
3. 页面跳转后就能看到相应的房地产经纪机构是否有备案证明。

办理流程材料：

1. 书面材料：包括《企业法人营业执照》、《房地产经纪机构备案登记表》、《章程》等。
2. 上级批文或其他相关部门的批注文件，原资质证书的正、副本、IC卡及电子证书。如果经纪机构注册登记地和分支机构注册登记地不在同一行政区域内的，注册登记在前的机构应当对分支机构进行备案登记。
3. 企业章程，或分立、合并后机构设置的文件，其中要包括股东会、股东大会决议及企业法定代表人证明材料。
4. 提供不少于5张新老资质印章的复印件。

准备好材料后，需要先进行网上备案，然后提交书面材料。书面材料提交到上海市住房和城乡建设管理委员会，审核通过后领取《房地产经纪机构备案证明》。

以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能根据实际情况有所调整，建议咨询相关部门获取具体信息。